Der Naturschutzbund Deutschland (NABU) verfügt über verbandseigene Naturschutzinstitute, von denen drei ihren Sitz in Sachsen haben. Ihre Entstehung geht auf das Jahr 1993 zurück. Damals kam im NABU-Landesverband die Überlegung auf, die naturschutzfachlichen Arbeiten in mehreren dem Landesverband angegliederten Naturschutzinstituten anzusiedeln. Diese wurden in den Regierungsbezirken Leipzig, Dresden und Chemnitz gegründet.

Das Naturschutzinstitut Freiberg (NSI) wurde im September 1993 mit dem Ziel gegründet, durch faunistische, floristische und ökologische Untersuchungen sowie durch naturschutzfachliche Analysen einen Beitrag für einen wirksamen Naturschutz zu leisten.

Durch seinen Ursprung und ehemaligen Sitz im Naturkundemuseum Freiberg besitzt das Institut enge Verbindungen zu Museen, wissenschaftlich bzw. planerisch tätigen Einrichtungen und Behörden. Traditionell ist das Naturschutzinstitut Partner für auf biologischem und ökologischem Gebiet ehrenamtlich tätige Bürger. Seit 2008 wird das NSI durch die Arbeitsgruppe Naturschutzinstitut Freiberg e. V. im NABU Landesverband Sachsen e. V. betrieben.  

Die satzungsgemäßen Aufgaben umfassen u.a.:

• Biotop- und Artenschutz mit dem Ziel der Erhaltung, Schaffung und Verbesserung der Lebensräume von Pflanzen und Tieren
• die wissenschaftliche Dokumentation von Naturausstattung, Flora und Fauna des vom Verein bearbeiteten Territoriums
• Erforschung von Flora und Fauna; Biotop- und Ökosystemanalyse
• die wissenschaftliche Planung, Betreuung und Beratung von Maßnahmen des Naturschutzes sowie von Naturschutzobjekten
• die naturschutzfachliche Begleitung von Projekten und Investitionsmaßnahmen
• die Zusammenarbeit mit Naturschutzbehörden und anderen auf dem Gebiet des Natur- und Umweltschutzes tätigen Institutionen und Verbänden sowie deren naturschutzfachliche Beratung
• die Organisation und Durchführung von Fachtagungen und Seminaren
• die Information und Beratung von interessierten Bürgern